《指南》把慢性乙肝明确划分成两类：HBeAg阳性和HBeAg阴性慢性乙型肝炎(俗称的“大三阳”和“小三阳”慢性乙肝)。
只要乙肝病毒在积极复制，肝功能受损，这两类慢性乙肝患者都应该尽早接受抗病毒治疗，但何时应用抗病毒治疗必须基于检查结果。
乙肝病毒“深藏不露”，虽然有些病人可以获得彻底治愈，但大多情况下，病毒很难被彻底清除。但是，不能清除乙肝病毒并不等于不能控制乙肝病情。
对于HBeAg阳性慢性乙肝患者，临床上可实现的目标是通过激活人体自身的“免疫攻势”，来获得持续抑制病毒“繁衍”的效果。
在这种状态下，患者对乙肝病毒产生了免疫力，病毒复制受到有效扼制，同时HBeAg转换，即使停药，也能保持持久的病情稳定。《指南》称此种状态为患者对抗病毒治疗的“完全应答”。
HBeAg阴性慢性乙肝患者，症状隐秘，经常被漏诊。这类肝炎的患者年龄偏大，肝脏的炎症以及肝硬化的程度更重，现有的治疗方案复发率高。
《指南》明确规定了这类患者接受抗病毒治疗所，必须具备的各项指标，并指出此类患者复发率高，疗程宜长，至少为1年。
患者最好选用干扰素或聚乙二醇化干扰素，或耐药发生率低的核苷(酸)类似物治疗，直到患者肝功能显示正常，病毒复制得到有效控制。
《指南》引用的数据显示，超过40%的“小三阳”慢性乙肝患者在接受聚乙二醇化干扰素治疗停药一年后，仍可获得持续的病毒抑制和正常的肝脏功能。
《指南》的颁布，对医生正确诊疗、患者正确看病，都起到很大的指导作用。那个45%的尴尬数据也因此大幅度减少。
这对防治“中国第一病”，是一个很大的利好消息。但是，勿需讳言，还有部分医务人员对它把握不准，吃得不透，或者漠然视之，否则，就不会发生那种过度诊疗的问题了。
从这个意义上来说，医务人员应该尽快熟悉乙肝诊治标准，并认真遵循和执行《指南》的规范、要求。 乙肝诊治亟待“立规矩”
对“中国第一病”的过度诊疗是医院以经济创收为 目标的产物。医院自身发展需要金钱，必然要通过多开药、开好药、多检查，加大仪器使用频率来争取利润最大化。
于是，在某些医院，每一个科室和每一名医务人员的奖金都被要求与每一种药品、每一种仪器、每一张化验单直接挂钩，过度诊疗自然不可避免。
医疗机构滥开药、滥检查等导致医疗资源浪费可达20%～30‰同时，加重了患者的经济负担和身体伤害。
这些年，专家们一致呼吁，作为乙肝大国，如果没有一个规范的治疗环境，如果没有一个权威的、具有法规意义的指导文件，乙肝治疗市场不堪设想。
专家们建议像对待传染病肺结核一样，尽快制定出规范的肝病诊治方案(包括中医、西医、中西医结合)，由国家有关权威部门讨论通过，这一方案应该包括如何联合用药、用药的时机、用药的完整疗程、用药的剂量和规律、用药的适应症和禁忌症等。
目前，我国肺结核治疗已经采取了较为规范的通用治疗方案，即国际防痨和肺病联合会方案和卫生部审定推荐的全国统一方案，以异烟肼为主的联合用药，对于“初始病例用什么”“耐药病例用什么”“巩固期用什么”都有明文规定。在专家的大力呼吁下，2005年底终于出台了《指南》。
但是，还有其他方面的一些规范亟待建立。比如，如何规范从业人员的资格。
当前，治疗乙肝的人员成分相当复杂，包括具有执业资格的传染病专科医生和非传染病科医生、各种诊所里的“全能”或“专科”医生以及不具备执业资格的江湖游医。这样一来，乙肝的治疗主体很不规范，难以保证治疗的质量和效果。
一些人通过金钱运作，凭借所谓“金奖”“银奖”的光环，自诩为治疗乙肝的“克星”，贻害患者。这一不正之风，必须刹住。
与此同时，乙肝治疗场所亟待规范。我国《传染病防治法》明确规定乙肝为二类传染病，新发现的病例需要统一上报地方卫生防疫部门进行登记，对乙肝患者统一收治、统一管理。
可是，一些医院不管有无条件，争相开设肝病门诊牟利，导致许多地方的传染病专科医院形同虚设，乙肝患者被层层截流。
有些乙肝诊所设在人员大量出入的闹市区域，有些大型乙肝义诊活动专找闹市区开展，无形中加大了乙肝传播的可能性。
医疗行业急需加强自律。由于信息不对称，作为弱势群体的患者大都不懂诊疗常规，他们的求医经历通常是被动的，医生让做什么检查、让吃什么药，患者基本无条件服从。如果医疗机构和医务人员失去自律，一心向“钱”看，过度诊疗现象必将有增无减。制定乙肝诊疗的行业自律准则、加强医德医风教育迫在眉睫。
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